內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)關(guān)于乳桿菌屬比較基因組學(xué)研究成果
內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)關(guān)于乳桿菌屬比較基因組學(xué)研究成果在Nature子刊《Nature Communications》上發(fā)表。
9月30日，由我內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)張和平教授研究團(tuán)隊(duì)作為第一單位完成的乳桿菌屬比較基因組學(xué)和功能基因組學(xué)研究成果發(fā)表于《Nature Communications》，題為“Expanding the biotechnology potential of lactobacilli through comparative genomics of 213 strains and associated genera”。
該項(xiàng)研究由內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國人民解放軍軍事科學(xué)醫(yī)學(xué)院、愛爾蘭考克大學(xué)、美國紐約大學(xué)、荷蘭瓦格寧根大學(xué)、美國北卡州立大學(xué)等11個(gè)科研單位的30多位科研人員歷時(shí)三年完成。期間，從我國、德國、日本、韓國和美國多個(gè)菌種保藏中心、研究機(jī)構(gòu)共收集乳桿菌屬模式菌株213株，采用二代Illumina HeSeq 2000高通量測(cè)序平臺(tái)繪制其基因組精細(xì)圖譜，結(jié)合比較基因組和功能基因組分析方法，解析與菌株分化相伴隨的功能基因進(jìn)化歷程，拓展其生物應(yīng)用潛力。
這項(xiàng)研究從基因組水平首次揭示了乳桿菌屬不同模式菌株間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，并指出乳桿菌屬為一個(gè)并系類群，是由從一個(gè)特定的共同祖先不斷進(jìn)化分化而成，即兼性異型發(fā)酵乳桿菌為了適應(yīng)環(huán)境逐漸分化形成嚴(yán)格同型和異型發(fā)酵乳桿菌，提出用于新種分類的新的基因組系統(tǒng)發(fā)育框架。通過比較基因組學(xué)分析，我們還發(fā)現(xiàn)乳桿菌屬編碼大量的碳水化合物水解酶和糖基轉(zhuǎn)移酶，同時(shí)擁有豐富多樣的CRISPR-CAS系統(tǒng)。在適應(yīng)性進(jìn)化過程中，伴隨有蛋白水解系統(tǒng)獲得、丟失的現(xiàn)象。
據(jù)悉，《Nature Communications》是一個(gè)多學(xué)科的綜合性期刊，專門發(fā)表各領(lǐng)域高質(zhì)量研究論文，最新影響因子為11.470。
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