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飼料中添加植物乳桿菌對細(xì)鱗鮭生長及腸道菌群多樣性的影響

2020-11-02 16:24:42      點(diǎn)擊:

摘要:本試驗(yàn)旨在研究飼料中添加植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)對細(xì)鱗鮭生長及腸道菌群多樣性的影響。以基礎(chǔ)飼料為對照組,在基礎(chǔ)飼料中添加1×106 CFU/g植物乳桿菌為試驗(yàn)組,每組3個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)25尾平均體重5 ~ 8 g的細(xì)鱗鮭,在室內(nèi)養(yǎng)殖56 d后,取中后腸段內(nèi)容物及其黏膜,提取微生物DNA,采用高通量測序技術(shù)檢測腸道菌群多樣性。結(jié)果顯示:與對照組相比,飼料中添加植物乳桿菌可顯著增加細(xì)鱗鮭的特定生長率(P<0.05)。α多樣性分析顯示試驗(yàn)組腸道菌群多樣性(Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù))和豐富度(Ace指數(shù)、Chao 指數(shù))均較對照組顯著降低(P<0.05)。β多樣性分析發(fā)現(xiàn)試驗(yàn)組和對照組腸道菌群分群明顯。在門水平上,試驗(yàn)組腸道菌群中厚壁菌門(Firmicutes)的豐度達(dá)96.03%,而對照組主要由幾個(gè)豐度較大的菌門組成,分別為厚壁菌門(23. 79%)、藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)(23. 30%)、擬桿菌門(Bacte⁃roidetes)(8.95%)、螺旋菌門(Spirochaetae)(6.67%)和放線菌門(Actinobacteria)(5.35%)。在屬水平上,試驗(yàn)組腸道菌群中豐度大于1% 的菌屬僅有3個(gè),為乳桿菌屬(Lactobacillus)(58.94%)、微小桿菌屬(Exiguobacterium)(26.00%)和腸球菌屬(Enterococcus)(10.62%),總豐度達(dá)95.66%,而對照組豐度大于1%的菌屬達(dá)11個(gè),但總豐度僅為58.24%,主要有未命名_藍(lán)細(xì)菌門(unclassified_Cyanobacteria)(23.30%)、勞爾氏菌屬(Ralstonia)(11. 70%)、短螺旋體屬(Brevinema)(6.67%)和普氏菌屬(Prevotella)(3.90%)。綜上,飼料中添加植物乳桿菌能促進(jìn)細(xì)鱗鮭的生長,提高其腸道中乳酸菌的比例,抑制其他菌群的生長,降低腸道菌群的多樣性。

動物腸道內(nèi)存在著一個(gè)數(shù)量巨大的菌群生態(tài)系統(tǒng),這些菌群與其宿主動物相互作用,對動物生理功能產(chǎn)生了重要影響。多數(shù)情況下,這種影響是有益的,能夠增強(qiáng)動物免疫力、促進(jìn)營養(yǎng)吸收,在抑制外來有害菌群、保護(hù)動物腸道健康方面也起到了重要作用。因此,益生菌對動物生理功能及腸道菌群的改善引起了人們的關(guān)注。目前對水生生物腸道菌群的研究集中于2個(gè)方面:一是對魚類腸道菌群組成的研究。例如,黃麗麗等用16S rRNA基因高通量測序的方法研究了新疆額爾齊斯河流域的多種冷水魚類,包括狗魚(Esox reicherti)、哲羅魚(Hucho taimen)、細(xì)鱗鮭的腸道微生物菌群結(jié)構(gòu),在門和屬的水平上揭示了魚類腸道菌群的組成。Wu等研究發(fā)現(xiàn)草魚(Ctenopharyngodon idellus)腸道內(nèi)含有大量纖維素降解菌,其中變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)是草魚腸道的核心菌群。二是對魚類腸道菌群調(diào)控的研究,目的是通過調(diào)控腸道菌群來改善動物的免疫、生長、營養(yǎng)等狀態(tài)。例如,Nikoskelainen等使用鼠李糖乳桿菌(Lactobacillus rhamnosus)調(diào)控虹鱒(Oncorhynchus mykiss)腸道菌群組成,增加了乳桿菌、雙歧桿菌(Bifidobacterium)等有益菌的數(shù)量,并抑制了有害菌的增殖。尹軍霞等給鯽魚(Carassius auratus)飼喂添加乳酸桿菌的飼料,通過培養(yǎng)基分離培養(yǎng)的方法發(fā)現(xiàn)益生菌投喂增加了鯽魚腸道雙歧桿菌及乳酸桿菌的數(shù)量。在營養(yǎng)調(diào)控方面,Bogut等發(fā)現(xiàn)益生菌復(fù)合制劑能夠改善鯉魚(Cyprinus carpio)的生長速度和飼料轉(zhuǎn)化率。Hoseinifar等發(fā)現(xiàn)嗜酸乳桿菌(Lactobacillus acidophilus)能提高養(yǎng)殖10周的劍尾魚(Xiphophorus helleri)皮膚黏膜免疫功能,還能提高其增重率及特定生長率,降低飼料轉(zhuǎn)化率。Gioacchini等使用鼠李糖乳桿菌飼喂斑馬魚(Danio rerio),發(fā)現(xiàn)益生菌促進(jìn)了斑馬魚的排卵數(shù)量及破膜率,卵母細(xì)胞成熟相關(guān)基因的表達(dá)上調(diào)。

細(xì)鱗鮭(Brachymystax lenok)是一種常年生活在低溫水環(huán)境下的冷水魚類,其生活水溫通常不超過18℃。因此,在低溫條件下,益生菌能否影響腸道菌群并發(fā)揮其功能,有待探索驗(yàn)證。植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)是飼料及食品中常用的益生菌,可分泌乳酸,抑制有害菌,幫助分解膽固醇及脂類,提高動物免疫力和健康水平。本文擬就植物乳桿菌在冷水魚細(xì)鱗鮭腸道菌群調(diào)控中的作用進(jìn)行研究,為冷水魚中益生菌的研究及應(yīng)用提供參考。

1.材料與方法

(1)試驗(yàn)設(shè)計(jì)

飼養(yǎng)試驗(yàn)在內(nèi)蒙古民族大學(xué)冷水魚養(yǎng)殖實(shí)驗(yàn)室內(nèi)進(jìn)行,具有水溫調(diào)控系統(tǒng)和過濾系統(tǒng)。細(xì)鱗鮭魚苗購自丹東鳳城冷水魚養(yǎng)殖基地,魚苗體長6 ~ 7 cm,體重5 ~ 8 g,先預(yù)養(yǎng)殖20 d。將試驗(yàn)魚于6個(gè)養(yǎng)殖桶內(nèi)養(yǎng)殖,養(yǎng)殖桶高1.5 m,直徑1.5 m,底部直徑1.2 m,每桶投放25尾。將6個(gè)養(yǎng)殖桶編號,A1、A2、A3分至對照組,B1、B2、B3分至試驗(yàn)組,對照組投喂基礎(chǔ)飼料,試驗(yàn)組投喂添加植物乳桿菌(購自中國科學(xué)院微生物研究所)飼料,每日投喂2次,日投喂量占魚體重的10% ~ 15%(根據(jù)魚類攝食情況調(diào)節(jié)投喂量),每日使用吸底器吸除底部殘留的魚餌和糞便。試驗(yàn)期間,2 ~ 3 d換水1次,換水量為總水量的40% ~ 60%;養(yǎng)殖水溫控制在12 ~ 15℃ ,溶氧水平控制在6 mg/mL以上,pH為6.7±0.4,循環(huán)水流動從養(yǎng)殖桶頂部流下。養(yǎng)殖起始時(shí)間為2017年11月15日,結(jié)束時(shí)間為2018年1月10日,試驗(yàn)期56 d。

(2)飼料制備

飼養(yǎng)試驗(yàn)使用自制的全價(jià)配合顆粒飼料,粒徑2 ~ 3 mm,基礎(chǔ)飼料組成及營養(yǎng)水平見表1。試驗(yàn)組飼料是在基礎(chǔ)飼料上噴植物乳桿菌菌液,使每克飼料中植物乳桿菌活菌數(shù)量達(dá)到1×106 CFU。


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(3) 樣本采集與處理

在養(yǎng)殖28和56 d時(shí)各采樣1次,其中28 d時(shí)僅測定體長、體重,并每桶取3條魚解剖取肝臟稱重。取樣前停食24 h,先對各桶魚進(jìn)行計(jì)數(shù),稱重,測量體長,計(jì)算特定生長率。每桶取3尾規(guī)格基本一致的魚,先用MS⁃222麻醉,然后用70%酒精擦拭魚體表面,在超凈臺內(nèi)無菌操作,解剖、分離并取出肝臟,對肝臟稱重,分離并取出中后腸段的內(nèi)容物,然后用滅菌解剖刀刮取腸道內(nèi)側(cè)黏膜,與內(nèi)容物混合后,液氮速凍,-80℃保存。

(4)生長指標(biāo)的計(jì)算

增重率(%)=[(終末體重–初始體重)/初始體重] ×100

特定生長率(%/d)= [(ln終末體重–ln初始體重)/養(yǎng)殖天數(shù)] ×100

肝體指數(shù)(%)=(肝體重/體重)×100

(5) 腸道菌群多樣性的測定

取約0.5 g腸道內(nèi)容物與黏膜混合樣品,按照使用MP⁃bio土壤DNA提取試劑盒說明提取細(xì)菌基因組,將提取的DNA進(jìn)行1.5%瓊脂糖凝膠電泳,并用Nanodrop對DNA的濃度和OD260 nm/OD280 nm值進(jìn)行測定。

首先針對16S rRNA基因的V3 ~ V4區(qū)設(shè)計(jì)引物,引物兩端帶有12 bp的barcode,用以識別不同樣品的序列。然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,程序如下:95 ℃預(yù)變性3 min,之后進(jìn)入擴(kuò)增循環(huán),循環(huán)數(shù)27,循環(huán)過程為95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,最后是72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物使用2%濃度的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測;使用Thermo Scientific公司的GeneJET膠回收試劑盒回收產(chǎn)物;使用Illumina測序?qū)S玫腘EB NextUltraTM DNA Library Prep Kit試劑盒按照說明建立基因克隆文庫。構(gòu)建好的文庫經(jīng)過Qubit定量和檢測合格后,基于Illumina Miseq PE300平臺進(jìn)行高通量測序(上海美吉生物工程有限責(zé)任公司)。

使用Usearch (version 7.0)軟件( http://drive5.com/uparse/),將所得序列根據(jù)97%相似度關(guān)系進(jìn)行操作分類單元(OTU)聚類分析,產(chǎn)生OTU表,并與Silva數(shù)據(jù)庫(http://www.arb⁃silva.de)比對進(jìn)行分類學(xué)分析,所用平臺為Qiime平臺(http://qiime.org/scripts/assign_taxonomy. html),統(tǒng)計(jì)后得到各樣本的群落組成。然后對群落進(jìn)行基于OTU水平的α多樣性分析,所用軟件為Mothur(version v.1.30.1,http://www.mothur.org/wiki/Schloss_SOP#Alpha_diversity),分析指標(biāo)包括Sobs指數(shù)、Shannon指數(shù)、Chao指數(shù)、Simpson指數(shù)、Ace指數(shù)以及覆蓋度(coverage)。腸道菌群組成分析及熱圖使用R語言工具作圖,主成分分析(PCA)采用R語言的vegan軟件包進(jìn)行分析和作圖。

(6)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

試驗(yàn)數(shù)據(jù)經(jīng)Excel 2007軟件初步整理后,使用SPSS 19.0軟件進(jìn)行單因素方差分析(one⁃wayANOVA),采用Tukey法進(jìn)行平均值間的多重比較,P<0.05為差異顯著,描述性統(tǒng)計(jì)值以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示。

2. 結(jié)果與分析

(1)植物乳桿菌對細(xì)鱗鮭生長的影響

由表2可知,經(jīng)過56 d的養(yǎng)殖,對照組試驗(yàn)魚體重為(18.23±0.45) g/尾,試驗(yàn)組試驗(yàn)魚體重為(19.08±0.14) g/尾,組間差異顯著(P <0.05);試驗(yàn)組的增重率在養(yǎng)殖28及56 d時(shí)均顯著高于對照組(P<0.05)。試驗(yàn)組的特定生長率在養(yǎng)殖28及56 d時(shí)均顯著高于對照組(P

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(2) 基于16S rRNA 基因測序的α多樣性

獲得原始序列數(shù)1228410條,經(jīng)過質(zhì)量控制,包括去除質(zhì)量值低于20的尾部堿基及含氮的堿基,根據(jù)雙端序列間的重疊關(guān)系進(jìn)行序列拼接,通過末端條形碼識別得到每個(gè)樣本的序列,最終得到優(yōu)化序列數(shù)312339條,平均序列長度為444.85bp。其中對照組獲得的有效序列數(shù)為43165條,試驗(yàn)組獲得的有效序列數(shù)為58910條,2組之間差異顯著(P<0.05)(表3)。在后續(xù)分析中,為降低統(tǒng)計(jì)誤差,將每個(gè)樣本序列數(shù)抽平至37818條。

各組的覆蓋度均約等于1.00,說明了該測序結(jié)果已基本覆蓋樣本的多樣性。基于97%相似性水平劃分得到810個(gè)OTU,它們分別歸屬644個(gè)種、454個(gè)屬、213科、113目、53綱、26門。α多樣性指數(shù)包括Sobs指數(shù)、Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù)、Ace指數(shù)、Chao指數(shù),對對照組和試驗(yàn)組α多樣性指數(shù)的平均值進(jìn)行顯著性分析,結(jié)果顯示2組之間上述指標(biāo)均存在著顯著差異(P < 0.05)(表3)。此外,Sobs指數(shù)由對照組的439降低到試驗(yàn)組的196,組間差異顯著(P<0.05)(表3),表明植物乳桿菌的添加顯著降低了樣本中所觀察到的物種數(shù)目;Shannon指數(shù)由對照組的4.0183降低到了試驗(yàn)組的1. 3275,Simpson指數(shù)由對照組的0.0986升高到了試驗(yàn)組的0.4029,表明對照組細(xì)鱗鮭腸道菌群多樣性較試驗(yàn)組腸道高,植物乳桿菌的添加顯著降低了細(xì)鱗鮭腸道菌群多樣性;Chao指數(shù)由對照組的446.2992降低到了試驗(yàn)組的249.3476,Ace指數(shù)由對照組的443.7244降低到了試驗(yàn)組的251.1307,表明對照組細(xì)鱗鮭腸道菌群物種豐富度較試驗(yàn)組高,植物乳桿菌的添加顯著降低了細(xì)鱗鮭腸道菌群物種豐富度。稀釋曲線(圖1)顯示,各樣本曲線均已進(jìn)入平臺期,表明測序深度可靠,能夠真實(shí)反映樣本中大多數(shù)微生物組成情況。

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(3) 植物乳桿菌對細(xì)鱗鮭腸道菌群組成的影響

在門水平上,試驗(yàn)組腸道菌群中,厚壁菌門的豐度達(dá)96.03%,占絕對優(yōu)勢,變形菌門的豐度為2.54%,其他門類的豐度均低于1%。對照組腸道菌群中,厚壁菌門的豐度為23.79%,相比試驗(yàn)組差異顯著(P< 0.05),藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)的豐度為23.30%,擬桿菌門(Bacteroidetes)的豐度為8.95%,螺旋菌門(Spirochaetae)的豐度為6.67%,放線菌門(Actinobacteria)的豐度為5.35%,豐度低于1%的物種的總豐度很高,達(dá)到41.28%。

在屬水平上,對照組和試驗(yàn)組腸道菌群組成差別也很大。對照組中豐度在1%以上的屬有11個(gè),豐度低于1%的屬的總豐度達(dá)41.76%,其中豐度相對較高的菌屬有未命名_藍(lán)細(xì)菌門(norank_c_Cyanobacteria)(23.30%)、勞爾氏菌屬(Ralstonia)(11.70%)、短螺旋體屬(Brevinema) (6.67%)、普氏菌屬(Prevotella)(3.90%)和乳桿菌屬(Lactobacillus)(2.89%)。而試驗(yàn)組中豐度高于1%的菌屬僅有3個(gè),以乳桿菌屬的豐度最高,占58.94%,微小桿菌屬(Exiguobacterium)占26.00%,腸球菌屬(Enterococcus)占10.62%,其他豐度低于1%的菌屬的總豐度僅占4.44%。

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(4) 植物乳桿菌對細(xì)鱗鮭腸道菌群β多樣性的影響

三維PCA圖(圖4)顯示,來自試驗(yàn)組和對照組的腸道菌群樣本分別聚類成2 個(gè)群體,這種聚類主要體現(xiàn)在主成分1(PC1)上,PC1坐標(biāo)軸的影響因素占總成分的73.89%。Venn圖(圖5)分析顯示,在所有樣本的1107個(gè)OTU中,共有OTU數(shù)為359個(gè),占OTU總數(shù)的32.40%;對照組特有OTU數(shù)達(dá)到了418個(gè),占OTU總數(shù)的37.80%;而試驗(yàn)組特的OTU數(shù)為34個(gè),僅占OTU總數(shù)的3.10%。試驗(yàn)組OTU數(shù)(393個(gè))遠(yuǎn)少于對照組(777個(gè)),使得物種豐富度降低約49.42%。

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為反映細(xì)鱗鮭腸道菌群與植物乳桿菌處理的關(guān)系,進(jìn)行了熱圖構(gòu)建分析(圖6),圖中不同的顏色代表了不同菌群的豐度,左側(cè)代表基于屬水平的菌群系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,圖中頂端代表樣品聚類關(guān)系。熱圖顯示,對照組的3個(gè)樣本彼此臨近,而試驗(yàn)組的3個(gè)樣本彼此臨近,2組樣本各自聚類成1個(gè)群體,結(jié)合菌群的進(jìn)化關(guān)系,說明2組細(xì)鱗鮭腸道菌群組成差別明顯。從熱圖還可以看出,添加植物乳桿菌導(dǎo)致許多菌屬受到抑制甚至從腸道菌群中消失,如葡萄球菌屬(Staphylococcus)、桿菌屬(Geobacillus)、梭菌科-1屬(Clostridiaceae_1)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、無氧芽孢桿菌屬(Anoxybacillus)、芽孢八疊球菌屬(Sporosarcina)、副伯克氏菌屬(Paraburkholderia)、鏈球菌屬(Streptococcus)、類諾卡氏菌屬(Nocardioides)、氣單胞菌屬(Aeromonas)、普氏菌屬等。此外,相比對照組,試驗(yàn)組中腸球菌屬、乳桿菌屬、微小桿菌屬這3個(gè)菌屬的豐度增加明顯。與之對應(yīng)的是,Venn圖顯示多達(dá)284個(gè)OTU從試驗(yàn)組中消失(圖5),說明添加的植物乳桿菌在細(xì)鱗鮭腸道內(nèi)抑制了多種菌群的生長,改變了其菌群組成。

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3. 討論

健康的腸道菌群結(jié)構(gòu)對動物多種生理機(jī)能有重要的影響,如營養(yǎng)吸收、生長發(fā)育、免疫調(diào)節(jié)、疾病預(yù)防等。本研究發(fā)現(xiàn),雖然添加植物乳桿菌未對細(xì)鱗鮭的體長產(chǎn)生顯著影響,但對細(xì)鱗鮭的體重有一定的促進(jìn)作用,在養(yǎng)殖期28和56d時(shí)均提高了特定生長率。Carnevali等使用德氏乳桿菌(Lactobacillus delbrueckii)投喂歐洲鱸魚(Dicentrarchus labrax),經(jīng)25和59 d養(yǎng)殖后,發(fā)現(xiàn)其增重率分別比對照組提高了28%和81%。Lee等用戊糖乳桿菌(Lactobacillus pentosus)飼喂日本鰻鱺(Anguilla japonica),5周后發(fā)現(xiàn)在特定生長率、飼料轉(zhuǎn)化率及存活率方面均顯著優(yōu)于對照組。

Illumina高通量測序技術(shù)測序深度大,對菌群多樣性的反應(yīng)準(zhǔn)確、全面,在魚類腸道菌群研究中獲得了廣泛應(yīng)用。李建柱等采用高通量測序技術(shù)分析了養(yǎng)殖池塘鰱魚、鳙魚、鯽魚、草魚的腸道菌群組成,OTU數(shù)最低298個(gè),最高412個(gè),Shannon指數(shù)介于2. 21 ~ 3. 09。黃麗麗等在新疆額爾齊斯河流域的3種野生冷水魚(哲羅魚、細(xì)鱗鮭及黑斑狗魚)的6個(gè)樣品中共得到了58328條有效序列,OTU 數(shù)共242個(gè)。本研究中,6個(gè)樣本共獲得了有效序列數(shù)612446條,其中試驗(yàn)組(58909條)有效序列數(shù)多于對照組(43164條),對照組OTU數(shù)777個(gè),試驗(yàn)組OTU數(shù)393個(gè),且物種多樣性和豐富度方面對照組遠(yuǎn)大于試驗(yàn)組,說明益生菌植物乳桿菌降低了養(yǎng)殖細(xì)鱗鮭腸道菌群多樣性,使其菌群種類向簡單化發(fā)展。

魚類腸道菌群組成受宿主種類、發(fā)育時(shí)期、環(huán)境和飼料影響而有所差異。對新疆額爾齊斯河流域野生細(xì)鱗鮭腸道菌群組成的研究發(fā)現(xiàn),變形菌門是細(xì)鱗鮭腸道菌群中的優(yōu)勢菌門,屬水平上以嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)、不動桿菌屬(Acinetobacter)、梭菌屬(Clostridium)等的比例較高。本研究發(fā)現(xiàn),養(yǎng)殖細(xì)鱗鮭腸道微生物種類豐富,優(yōu)勢菌門也是變形菌門,此外,厚壁菌門及藍(lán)細(xì)菌門的豐度也很高;在屬水平上與野生細(xì)鱗鮭差別較大,以勞爾氏菌屬、短螺旋體屬、普氏菌屬等的豐度較高。Lyons等同樣使用高通量測序技術(shù)研究了虹鱒的腸道菌群組成,發(fā)現(xiàn)γ-變形菌門占優(yōu)勢,其中腸桿菌科(Enterobacteriaceae)的耶爾森氏菌屬(Yersinia)、沙雷氏菌屬(Serratia)、哈夫尼菌屬(Hafnia)和肥大桿菌屬(Obesumbacterium)等優(yōu)勢明顯。總結(jié)來說,變形菌門是冷水魚腸道菌群中常見的優(yōu)勢菌門,而在屬水平上隨著種類、養(yǎng)殖環(huán)境的變化差異更大。

本研究表明,飼料中添加植物乳桿菌使細(xì)鱗鮭腸道菌群中益生菌的豐度增加,其中乳桿菌屬的豐度由對照組的2. 89%提高到了試驗(yàn)組的58.94%,增加了近20倍。此外,微小桿菌屬、腸球菌屬也占有很高的比例,它們均屬厚壁菌門的產(chǎn)乳酸菌。這些菌屬所占比例的增加使得試驗(yàn)組腸道菌群中厚壁菌門的豐度達(dá)到了98%以上。微小桿菌屬能夠利用糖類發(fā)酵產(chǎn)酸,主要產(chǎn)乳酸、乙酸和甲酸,該屬很多種類被開發(fā)為益生菌,用于環(huán)境改良。腸球菌屬也是乳酸菌家族的重要成員,來自該屬的許多乳酸菌用于食品發(fā)酵及維持動物腸道健康等,特別是糞腸球菌,是該屬中最具代表性的益生菌,該菌不但可以產(chǎn)生乳酸,還可以分泌細(xì)菌素,抑制有害菌群的發(fā)展。而乳酸菌作為益生菌也被廣泛用于調(diào)控動物腸道菌群,增強(qiáng)宿主免疫力,抑制有害菌群,改善動物營養(yǎng)吸收、生長、發(fā)育與繁殖等。類似的研究結(jié)果也在鯽魚、羅非魚及虹鱒等魚類的腸道菌群研究中得到證實(shí),表明植物乳桿菌對魚類腸道乳酸菌數(shù)量的提高具有顯著的效果。

物種豐富度是指群落中物種數(shù)目的多少,本試驗(yàn)結(jié)果表明植物乳桿菌使細(xì)鱗鮭腸道菌群物種數(shù)目變少,在OTU水平上顯示49.42%的OTU由于植物乳桿菌的添加而從腸道菌群中消失,表明植物乳桿菌抑制了許多腸道菌群的生長,降低了細(xì)鱗鮭腸道菌群的多樣性。而這些消失的菌群很多是腸道內(nèi)有害的革蘭氏陽性菌,如葡萄球菌屬、短螺旋體屬、桿菌屬、梭菌科、芽孢桿菌屬、副伯克氏菌屬、鏈球菌屬及類諾卡氏菌屬等。植物乳桿菌對藍(lán)細(xì)菌門的抑制作用也很顯著,其豐度從對照組的23.3%降低到了試驗(yàn)組的<1%。藍(lán)細(xì)菌是一類廣泛存在于環(huán)境中的古老菌群,經(jīng)常在動物腸道內(nèi)檢測到。藍(lán)細(xì)菌并非魚類腸道固有微生物,而是來自餌料攜帶或水環(huán)境。對鯽魚的研究也發(fā)現(xiàn),益生菌在增加乳酸菌豐度的同時(shí),顯著降低了另外一些細(xì)菌的豐度,如好氧菌及產(chǎn)氣莢膜梭菌(Clostridium perfringens)。

本試驗(yàn)通過在飼料中添加植物乳桿菌研究益生菌對細(xì)鱗鮭腸道菌群多樣性的影響,揭示了養(yǎng)殖模式下細(xì)鱗鮭腸道菌群的組成及其益生菌調(diào)控效應(yīng),為今后在魚類腸道微生物菌群調(diào)控技術(shù)方面以及在腸道微生物層面上研究冷水魚營養(yǎng)與生長、免疫與疾病等提供參考。

4. 結(jié)論

① 飼料中添加植物乳桿菌可以顯著提高細(xì)鱗鮭的特定生長率。

② 養(yǎng)殖細(xì)鱗鮭腸道菌群在門水平上以變形菌門、厚壁菌門和藍(lán)細(xì)菌門為主;在屬水平上分布較均勻,勞爾氏菌屬、短螺旋體屬、普氏菌屬的豐度較高但未形成優(yōu)勢菌屬,菌屬種類繁多且豐度都較低。

③ 飼料中添加植物乳桿菌顯著改變了細(xì)鱗鮭腸道菌群組成,在門水平上厚壁菌門占絕對優(yōu)勢,在屬水平上乳桿菌屬占優(yōu)勢,未命名_藍(lán)細(xì)菌門豐度明顯下降。  

④ 綜合認(rèn)為,飼料中添加植物乳桿菌可使細(xì)鱗鮭腸道菌群物種多樣性和豐富度降低,益生菌豐度增加,并可促進(jìn)細(xì)鱗魚生長。

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